Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT13Q9NUP7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms