Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms