Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC22A11Q9NSA0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC22A11Q9NSA0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC22A11Q9NSA0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC22A11Q9NSA0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC22A11Q9NSA0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A11Q9NSA0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC22A11Q9NSA0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC22A11Q9NSA0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC22A11Q9NSA0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC22A11Q9NSA0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC22A11Q9NSA0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms