Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
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