Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DUOX1Q9NRD9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX1Q9NRD9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms