Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA1

PDGFC, Platelet-derived growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFCQ9NRA1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFCQ9NRA1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms