Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM5Q9NQX1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM5Q9NQX1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM5Q9NQX1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM5Q9NQX1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM5Q9NQX1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM5Q9NQX1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM5Q9NQX1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM5Q9NQX1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM5Q9NQX1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM5Q9NQX1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM5Q9NQX1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM5Q9NQX1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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