Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SEC31BQ9NQW1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms