Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CRTAC1Q9NQ79 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms