Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms