Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRC4Q9NPP4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRC4Q9NPP4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms