Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms