Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTA1Q9NP79 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms