Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms