Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBX8Q9HC52 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms