Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms