Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9H4

VPS37B, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37BQ9H9H4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37BQ9H9H4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS37BQ9H9H4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37BQ9H9H4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37BQ9H9H4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37BQ9H9H4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37BQ9H9H4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37BQ9H9H4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37BQ9H9H4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37BQ9H9H4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37BQ9H9H4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37BQ9H9H4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37BQ9H9H4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37BQ9H9H4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37BQ9H9H4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms