Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7T0

CATSPERB, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPERBQ9H7T0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CATSPERBQ9H7T0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CATSPERBQ9H7T0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms