Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC86Q9H6F5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC86Q9H6F5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms