Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMPQ9H6B4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLMPQ9H6B4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms