Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SENP3Q9H4L4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SENP3Q9H4L4 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms