Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRABDQ9H4I3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms