Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C8

ILKAP, Integrin-linked kinase-associated serine/threonine phosphatase 2C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILKAPQ9H0C8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ILKAPQ9H0C8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ILKAPQ9H0C8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms