Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPR88Q9GZN0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPR88Q9GZN0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms