Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHLHE41Q9C0J9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms