Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCSER1Q9C0I3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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