Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms