Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SPEF2Q9C093 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPEF2Q9C093 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SPEF2Q9C093 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPEF2Q9C093 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPEF2Q9C093 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPEF2Q9C093 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPEF2Q9C093 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPEF2Q9C093 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPEF2Q9C093 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPEF2Q9C093 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPEF2Q9C093 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SPEF2Q9C093 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPEF2Q9C093 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPEF2Q9C093 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPEF2Q9C093 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPEF2Q9C093 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SPEF2Q9C093 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SPEF2Q9C093 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPEF2Q9C093 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPEF2Q9C093 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms