Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIFKQ9BYG3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms