Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MRPL4Q9BYD3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms