Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYCP2Q9BX26 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYCP2Q9BX26 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms