Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW11

MXD3, Max dimerization protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3Q9BW11 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MXD3Q9BW11 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms