Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms