Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRACR2AQ9BSW2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms