Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP2Q9BSJ2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP2Q9BSJ2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms