Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TINF2Q9BSI4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TINF2Q9BSI4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms