Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIKE1Q9BRV8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms