Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM2D3Q9BRN9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms