Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLSTN3Q9BQT9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN3Q9BQT9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms