Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC35.23■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
FYCO1Q9BQS8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
FYCO1Q9BQS8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms