Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BPIFA3Q9BQP9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms