Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOTCH4Q99466 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms