Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CDC5LQ99459 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms