Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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