Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX18Q96RF0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms