Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms