Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A9Q96Q91 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms