Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
YTHDC1Q96MU7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
YTHDC1Q96MU7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
YTHDC1Q96MU7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
YTHDC1Q96MU7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
YTHDC1Q96MU7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
YTHDC1Q96MU7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
YTHDC1Q96MU7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
YTHDC1Q96MU7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
YTHDC1Q96MU7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
YTHDC1Q96MU7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
YTHDC1Q96MU7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
YTHDC1Q96MU7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
YTHDC1Q96MU7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
YTHDC1Q96MU7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
YTHDC1Q96MU7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
YTHDC1Q96MU7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
YTHDC1Q96MU7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
YTHDC1Q96MU7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
YTHDC1Q96MU7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
YTHDC1Q96MU7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
YTHDC1Q96MU7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
YTHDC1Q96MU7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
YTHDC1Q96MU7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
YTHDC1Q96MU7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
YTHDC1Q96MU7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
YTHDC1Q96MU7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
YTHDC1Q96MU7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
YTHDC1Q96MU7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
YTHDC1Q96MU7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
YTHDC1Q96MU7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
YTHDC1Q96MU7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
YTHDC1Q96MU7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms