Protein–RNA interactions for Protein: Q96MM3

ZFP42, Zinc finger protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP42Q96MM3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZFP42Q96MM3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFP42Q96MM3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms