Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPZA3Q96KX2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms